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El área de Gestión de Proyectos de Innovación tiene como objetivos la vinculación, creación de sinergias con los actores del ecosistema de innovación y emprendimiento (empresa, Estado, academia, sociedad civil organizada), y la formulación e implementación de proyectos con recursos no reembolsables, dentro de las cadenas de productivas más importantes en la región.
Gestiona proyectos de innovación y emprendimiento con base científica y tecnológica. Asimismo, promueve la vinculación universidad – empresa.